何故か Mac の OS を最新の Mavericks(10.9.1)に変えたら Emacs の C-x C-f で表示されるデフォルトのパスが ルートの / に変わってしまったのでその対策。
対策法
下の対策はうまく動いてませんでした。homebrew の最新版だと対応されてるらしいので homebrew install --cocoa emacsで homebrew から入れたら解決します。
Emacs の設定に default-directory を追加したら OK
(setq default-directory "~/")